2 × 預混實時熒光定量快速PCR反應體系用戶需自備的試劑:cDNA 或 DNA 模板、引物、ROX Reference Dye/ROX Reference Dye II。
請按照不同品牌熒光定量PCR儀的使用說明書要求進行實驗操作。
操作示例:分別以20 µ l和50 µ l PCR反應體系為例:
1. PCR 反應體系的建立:
組分 | 20ul體系 | 50ul體系 |
DNA模板 | 1ul | 1ul |
正向引物(10uM) | 0.5ul | 1ul |
反向引物(10uM) | 0.5ul | 1ul |
2×RealStar Green Fast Mixture | 10ul | 25ul |
ROX Reference Dye/ROX Reference Dye II | 0.4ul | 1ul |
RNase-free H2O | 補足至20ul | 補足至50ul |
*模板量: 10-100 ng基因組DNA,或 1-10 ng cDNA 為參照,因不同物種的模板中含有的目的基因拷貝數不同,可對模板進行梯度稀釋,以確定最佳的模板使用量。 另外, Two Step RT-PCR 反應的cDNA( RT 反應液)作為模板時的添加量不要超過 PCR 反應液總體積的10% 。
*引物:通常引物濃度以 0.2 μM 可以得到較好結果,可以終濃度 0.1-1.0 μM 作為設定范圍的參考。擴增效率不高的情況下,可提高引物的濃度;發生非特異性反應時,可降低引物濃度,由此優化反應體系。為了獲得理想的 qPCR 的效果,擴增片段的長度建議為 80-200 bp 。
*不同儀器所需 ROX Reference Dye不同,或需要添加或不需要添加,請根據儀器說明進行操作。
2。PCR 反應條件的設置: 本制品中使用的HotStart Taq DNA Polymerase是利用抗Taq抗體封閉的HotStart DNA聚合酶,如果在PCR反應 前進行模板的預變性,通常設定為95℃、2 min,復雜或高GC模板適當延長時間至5 min。該DNA聚合酶在15 s內可完成至 少300 bp的擴增,可以滿足絕大多數的qPCR實驗;對于超過350 bp或者高GC含量的擴增子,建議增加延伸時間至60 s或者 采用三步法以提高擴增效率。
兩步法 PCR 擴增標準程序: |
預變性 | 95℃ | 2min |
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變性 | 95℃ | 15s | 40 Cycles
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退火/延伸 | 60℃ | 15-30s |
溶解曲線(儀器自動設置) |
三步法 PCR 擴增程序: |
預變性 | 95℃ | 2min |
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變性 | 95℃ | 15s | 40 Cycles
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退火 | 60℃ | 15-30s |
延伸 | 72℃ | 30s |
溶解曲線(儀器自動設置) |
注 : 以上舉例為常規 qPCR
反應系統,僅供參考。實際反應條件因模板、引物等的結構不同而各異 , 需根據模板、引物、目的片段的特點設定最佳反應條件,并根據比例放大或縮小反應體系。
3. 在相應的 real time PCR 儀器上完成實驗,并分析結果。