組分 | 質粒 DNA | PCR 產物 | 基因組 DNA |
ddH2O | 15ul | 16ul | 30ul |
10× CutOne Buffer 或 10× CutOne Color Buffer | 2ul | 3ula | 5ul |
底物 DNA | 2ul (up to 1ug) | 10ul (~0.2ug) | 10ul (5ug) |
SfiI | 1ul | 1ul | 5ul |
Total | 20ul | 30ul | 50ul |
a. 本體系適用于經過純化的 PCR 產物酶切。未純化的 PCR 產物具備一定的離子強度,10× Cutone Buffer 加入量可適當減少至 2 μl。但由于 DNA 聚合酶同時具有外切酶活性,會影響酶切產物,因此如下一步需進行(2)輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時離心以收集掛壁液滴;
(3)50℃溫育 15 min(質粒),或 15~30 min(PCR 產物),或 30~60 min(基因組 DNA);
(4)酚氯仿抽提或柱純化(可選);
(5) 如果使用 CutOne Color Buffer 進行酶切反應,得到的產物可以直接進行上樣電泳。
2、雙酶切或多酶切(1)每種快速內切酶的用量為 1 μl,并根據需要適當擴大反應體系;
(2) 所有快速內切酶的體積總和不得超過總反應體系的 1/10;
(3)如果所用的幾種快速內切酶的最適反應溫度不同,應先以最適溫度低的酶開始酶切,再添加最適溫度較高的酶,在其最適反應溫度下進行酶切反應。
3、適用于質粒的擴大反應體系
DNA | 1ug | 2ug | 3ug | 4ug | 5ug |
SfiI | 1ul | 2ul | 3ul | 4ul | 5ul |
10× CutOne Buffer 或 10× CutOne Color Buffer | 2ul | 2ul | 3ul | 4ul | 5ul |
Total | 20ul | 20ul | 30ul | 40ul | 50ul |
不同 DNA 中的酶切位點數量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 |
甲基化修飾影響
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
無影響 | 剪切受影響 | 剪切受影響 | 無影響 | 無影響 |
在不同反應緩沖液中的活性
| CutOne Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB CutSmart® Buffer | Takara QuickCut™ Buffer |
活性 | 100% | 100% | 100% | 100% |