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1 細胞質膜資料
1895 年 ,Overton 從研究細胞透性得出 " 細胞膜由連續的脂類物質組成 " 。
1925 年 Gorter&Grendel: 用脂單分子膜技術測定細胞膜中脂分子的總面積,提出: "細胞膜是由雙層脂分子組成 " 。
1935 年 Danielli&Davson :從測定膜的表面張力得出細胞膜的 " 三明治結構模型 ",即蛋白質-脂 - 蛋白質。
1959 年 Robertson: 用電鏡觀察生物膜提出 " 單位膜模型 " ,將膜的分子結構與超微機構統一起來
厚度: 2( 暗 ) 3.5( 亮 ) 2 (暗) =7.5
細胞質膜的主要功能概括如下:
(1) 為細胞的生命活動提供相對穩定的內環境 ;
(2) 選擇性的物質運輸,包括代謝底物的輸入與代謝產物的排除,其中伴隨著能量的傳遞;
(3) 提供細胞識別位點,并完成細胞內外信息跨膜傳遞;
(4) 為多種酶提供結合位點,使酶促反應而有序地進行;
(5) 介導細胞與細胞、細胞與基質之間的連接 ;
質膜參與形成具有不同功能的細胞表面特化結構。
2 膜蛋白
雖動物細胞主要有 9 種膜脂,而膜蛋白的種類繁多,多數膜蛋白分子數目較少,但卻賦予細胞膜非常重要的生物學功能。
根據膜蛋白分離的難易及其與脂分子的結合方式,膜蛋白可分為兩大類型:外在膜蛋白、內在膜蛋白。
(1) 外在膜蛋白為水溶性蛋白,靠離子鍵或其它較弱的鍵與膜表面的蛋白質分子或脂分子結合,因此只要改變溶液的離子強度甚至提高溫度就可以從膜上分離下來,膜結構并不被破壞。
(2) 內在膜蛋白與膜結合非常緊密,一般講只有用去垢劑 (detergent) 使膜解后才可分離出來。
獲得大量有生物學活性的質膜蛋白對我們顯得非常的重要。
附注:使用分級抽提方法獲得的“膜蛋白"中只有很少一部分是具備多跨膜區的整和膜蛋白,膜蛋白,到目前為止,仍然是蛋白組學的一個瓶頸,不管采用2-D技術也好,ICAT乃至proein microarray 都還不能有效解決這一問題。
二、蛋白抽提
談及蛋白分離,我們想到:超速離心,鹽析法、超濾法、凝膠過濾法、等電點沉淀法、離子交換層析、親和層析、吸附層析、逆流分溶、酶解法……有時這些方法常常組合到一起對特定的物質進行分離純化。由于蛋白質種類繁多,不同的蛋白質由于結構和組成的差異,其溶解度也各不相同. 根據蛋白質的溶解特性,同時可選擇不同的溶劑提取,分為水溶液提取和有機溶劑提取 .
但是針對膜蛋白的提取與細胞質蛋白,核蛋白提取不同之處在于它是嵌在膜中的,水溶性不好,基本方法就是用不同的離心速度去掉胞質蛋白等,zui后用去污劑把蛋白從膜中釋放出來。膜蛋白分離純化的重要步驟是選擇適當的增溶用表面活性劑,一般常用的有膽酸鹽,CHAPS( 一種離子去污劑), Emulgen 和 Lubrol 等表面活性劑。
1 、分離膜蛋白的方法(原則性):
1 )先分離膜,然后提取;如選用冷熱交替法、反復凍融法、超聲破碎法、玻璃勻漿法、自溶法和酶處理法使得細胞破碎,然后通過剃度離心得到含有膜蛋白的粗組分。(例如:michael11 液氮研磨組織,加入勻漿緩沖液及蛋白酶抑制劑。差速離心。蔗糖密度梯度離心。收集 37% 與 41%間的成分,即為質膜部分。裂解即可收集膜蛋白 )
2 )用特殊的去污劑選擇性的分離。 從膜上提取蛋白有許多困難 . 在多數情況下,都是采用去垢劑將疏水蛋白從其膜結構中溶解下來,然后將蛋白質穩定. 去垢劑的選擇通常是依據他對所需要蛋白質的提取效率來確定,但在某些情況下,還要考慮到以后的純化步驟 .雖然許多膜蛋白必須在去垢劑存在的情況下進行純化,但zui終仍可能需要除去去垢劑 .這常常會引起蛋白質失活,但如果蛋白質是用于測序的,他將不是一個問題 . 如果不是用于測序的,可考慮使用能夠黏附去垢劑的疏水珠 .許多文獻和生化試劑供應商的產品目錄中,都介紹有許多種不同的可用來溶解膜蛋白的去垢劑 . 然而,他們并不是普遍適用的 .在設計膜蛋白溶解方案時,必須考慮某一去垢劑的特殊性質 . 如 triton X-100 在 280nm 處有吸收,如果某蛋白質的測試與280nm 處的吸收有關,就應避免使用這類去垢劑 .
將膜制劑與胞質蛋白及細胞核分離后,再進一步從細胞膜制劑中將所需的膜蛋白增溶下來 .這種做法的好處是可以用強烈的去垢劑提取細胞骨架的相關蛋白,而無需考慮胞質蛋白、細胞核成分或染色質成分的混入 .使用這種方法所獲得的膜蛋白,無論在種類上還是數量上,都比酸溶解法所得到的蛋白( <5000Da )要多 .一般提取的膜蛋白量往往只占膜蛋白總量的不足 0.1% ,所以充分的膜蛋白的提取,無疑對于研究膜蛋白的結構和功能都是非常重要的 .第二種方法簡單,可靠,但有時含有其他蛋白。一般的都是利用 4 度時所有的蛋白質原則上都溶于 TritonX114 水溶液,在溫度超過 20 度時,此溶液分為水相和去污相;此時親水性蛋白溶于水相,疏水的膜蛋白溶于去污劑相中。利用此性質可提取膜蛋白。
3 ) 膜蛋白色譜 (Chromatography of Membrane Protein,CMP)CMP分離強疏水性蛋白、多肽混合物的層析系統,一般有去垢劑(如 SDS )溶解膜蛋白后形成 SDS-融膜蛋白,并由羥基磷灰石為固定相的柱子分離純化。羥基磷灰石柱具有陰離子磷酸基團( P- 端),又具有陽離子鈣( C-端),與固定相結合主要決定于膜蛋白的大小、 SDS 結合量有關。利用原子散射法研究 cAMP 的分離機制發現,樣品與 SDS結合后在離子交換柱上存在 SDS 分子、帶電荷氨基酸與固定相中帶電離子間的交換,從而達到分級分離的目的。
層析柱提取 http://www.alomone。。com/ (參步驟)
4) 順序抽提法:根據細胞蛋白溶解性的差異,用具有不同溶解能力的蛋白溶解液進行抽提的方法。用 Tris堿溶液裂解細胞提取高溶解性蛋白;把未溶解的 pellet 用標準液溶解提取高疏水性蛋白;zui后用含復合表面活性劑的蛋白溶解液,zui后可以再次抽提前兩次抽提后不能溶解的膜蛋白。
5)centrifugal protein extraction
原理:高滲的蛋白裂解液讓細胞溶漲破裂后,超高速離心
評價:盡管分級 ( 胞漿和胞膜 ) 之間有清洗的步驟 , 但是可溶蛋白組分和膜蛋白組分之間仍然有不少重復的點 . 該方法相較 MOLLOYMP 教授在 1998 年 electrophoresis 上發表的分級抽提法減去了*步 ( 用 tris 抽提水溶性蛋白 ) 和zui后一步 (極難溶蛋白 ), 在操作上也作了簡化 , 總而言之是一種不錯的方法。( codegreen )
6)detergent- based :提取時先裂解液裂胞膜(選用不同的去污試劑是關鍵),梯度離心分離細胞器 (ER),然后分級抽提方法。例如,去掉細胞器之后的 DEBRIS 就是核膜,再裂解得到核膜蛋白。而膜蛋白是裂胞膜時不溶的部分。
總的感受:細胞的量要很充足。之后的定性鑒定常用的方法有雙向免疫擴散、免疫電泳及聚丙稀酰胺凝膠電泳等。純化蛋白質濃度的定量測定可用雙縮脲法、酚試劑法或紫外光吸收法定量鑒定膜蛋白,方便迅速。
到目前為止,提取膜蛋白仍然是蛋白學的一個瓶頸。
2 、分離膜蛋白的方法(操作)
1)分離細胞膜蛋白的方法:
1、冰上刮下細胞后將細胞溶于有蛋白酶抑制劑的緩沖液 A 中,于室溫與液氮罐中反復凍融 2 次。
2、5000 轉 4 度離心,驅除核及未裂解的細胞。
3、取上清 12000 轉 4 度離心 10 分鐘取沉淀溶于有蛋白酶抑制劑的緩沖液 B 中。
4、12000 轉 4 度離心 10 分鐘取沉淀溶于有蛋白酶抑制劑的緩沖液 C 中提取后測蛋白濃度 ,SDS-PAGE 電泳,分裝后 -20 度保存備用。
buffer A : 1mMkcl,5mMNacl,3mM Mgcl2,50mM Hepes,1mM DTT,0.5ug/mlLeupeptin,20uM pmsf(PH=7.4)
buffer B : 1mMkcl,5mMNacl,3mM Mgcl2,50mM Hepes,1mM DTT,0.5ug/mlLeupeptin,20uM pmsf(PH=7.4) 1mM EGTA
buffer C : 0.5ug/ml Leupeptin,20uM pmsf,50mMTris-cl(PH=7.0),
2 )分離細胞膜蛋白的方法:
1 、細胞放在冰上,去除上清,用 pH7 。 4 的冷磷酸鹽緩沖液洗滌單層細胞兩次
2 、加入 1ml2%TritonX 溶液冰浴 15min
3 、刮下單層細胞, 4 度下 10 000g 5min 離心
4 、溶液 37 度水浴 10min 以分離水相和去污劑相,然后 37 度下 2 000g 離心 5min
5 、收集水相留作分析
6 、用 500ul 冰冷的 buffer C 溶解去污劑相沉淀,冰浴 2min 后加溫,在按步驟 6 再次離心
7 、按步驟 8 再次抽提去污劑相,用 buffer C 將洗滌后的去污劑相稀釋到初始體積
8 、用等量的 buffer A 分別稀釋水相與去污相,并進行免疫沉淀實驗
試劑:
1 、 2%tritonX114:2%TritonX114 、 50mmol/L Tris HCl ( pH7 。 5 )、蛋白酶抑制劑
2 、緩沖液 A (含 0 。 5mol/LNaCl 的 RIPA buffer )
3 、 buffer C
10mmol/L Tris HCl(pH7.5)
150mmol/L NaCl
5mmol/L EDTA(PH7.5)
3 )分離細胞膜蛋白的方法:
7M urea
2M thiourea
4%chaps
2.5%sb3-10
1000000 個細胞,可用此 buffer 1ml 。 冰浴勻漿。冰上置 30 分鐘。
4 度高速低溫離心 30min 。
取上清 -20 保存。
4 )分離組織膜蛋白的方法:
1 、取組織,加入 10ml Buffer A 于冰上充分勻漿。
2 、 J6-HC 離心機 800rpm , 4 ℃離心 10min 后,所得上清液轉入超速離心管。
3 、 100000g , 4 ℃離心 1hr 。棄去上清,沉淀用適量的 Buffer B 重懸,冰上孵育 2hr 后分裝至 EP 管,Eppendorf 臺式離心機 10000rpm , 4 ℃離心 30min 。
4 、收集所得上清液即為膜組份。
Buffer A : 0.32M 蔗糖, 5mM Tris-HCl ( PH 7.5 ), 120mM KCl , 1mM EDTA,1mMEDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/ml Aprotinin 。冰上預冷。
Buffer B : 20mM HEPES ( PH 7.5 ), 10% 甘油, 2% Triton X-100, 1mM EDTA,1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/mlAprotinin 。 冰上預冷。
5 )分離組織膜蛋白的方法:
RIPA
1XPBS
1%NP40
0.5 去氧膽酸鈉
0.1%SDS
以下用時加入
10mg/ml PMSF 異丙醇(終濃度 10ul/ml )
Aprotinin ( 30ul/ml )
1000mM Sodium Orthovandate ( 10ul/ml )
冰凍組織 100mg/ 細胞 1000000 個,可用 RIPA buffer 1ml 。 冰浴勻漿。冰上置 30 分鐘。
4 度高速離心 30min , 20000 轉低溫離心。
取上清 -20 保存。
6 )分離細菌膜蛋白的方法:
1、于 20ml 營養肉湯中培養細菌, 37 ℃, 200rpm 。
2、10000g 、 20min 、 4 ℃離心,去上清。
3、20ml 預冷的 Tris-Mg 緩沖液重懸,同樣條件離心,再重懸于預冷的 Tris-Mg 緩沖液。
④ 超聲波破碎細菌。
⑤ 3000g , 10min 、室溫下離心去除未破碎細菌。小心吸取上清(含有胞質成分和細菌外被成分)。
⑥ 超速離心 I : 100,000g , 60min , 4 ℃,去除上清(胞質成分),收集細菌外被成分。
⑦ 用 10ml 含 2 %的 SLS 的 Tris-Mg 緩沖液重懸沉淀物,室溫溫育 20-30min 。
⑧ 超速離心 II : 70,000g , 60min ,室溫沉淀收集外膜蛋白,去除上清(含細胞質膜)。重復⑦、⑧兩步。
⑨ 充分吸除上清,并根據沉淀體積大小用 0.1-0.2 ml 的 ddH2O 重懸沉淀物。根據公式:蛋白濃度 (mg/ml)=1.450D280-0.740 D260 測定外膜蛋白濃度,調節蛋白濃度至 40ug/ul ,該蛋白質樣品 -70 ℃貯存。
試劑
① Tris-Mg 緩沖液
10mM Tris-Cl
5mM MgCl2
pH 7.3 , 4 ℃保存
② 2%(w/v) 十二烷基肌氨酸鈉 (SLS)
7 )來源于 Methods Enzymology (1974)
1、取一定量酶處理的細胞,用勻漿器破碎,操作要溫和,使細胞膜保持完整。由于水與膜的疏水部分之間有反應,因此要掌握分離介質中的離心強度和滲透壓,以每克細胞濕重加40ml 介質。
2 、用 Potter-Elvehiem 勻漿器,桿與壁間間隙 0.5 ~ 0.6 μ m,14.4kr/min 上下勻漿 4 ~ 6次,每次 5S 。
3、過濾勻漿液, 150g 離心 10min ,保留上清,沉淀部分加入 50 μ l 介質,用勻漿器 1kr/min 勻漿 3 次, 150g離心 10min ,沉淀部分再加入上次勻漿的上清液。
4、合并 3 次上清液, 2kg 離心 10min ,棄上清,沉淀部分溶于 100 μ l 介質,離心 10min ,棄上清,留沉淀。
5、將沉淀部分加入 70% 蔗糖 15 份,然后分別置于三個離心管中,上面依次疊加 54% 、 49% 、 45% , 41% , 37%蔗糖溶液各 2 、 2 、 5 、 5 、 3 份。
6、 700kg 離心 90min ,分離介質在 1.16 ~ 1.18 之間形成介面。
7、收集 d 為 1.16 ~ 1.18g/ml 之間的細胞膜,加 30 倍的介質以 2.5kg 離心 10min ,洗滌 2 次。
8、保存于 2.7mmol/L Tris-HCl pH7.5 緩沖液中,用于細胞膜的研究分析
8 )常用的制備粗制質膜組分的方法:(所有操作都在 4 攝氏度下進行)
1. 在冰冷的勻漿緩沖液中切碎組織塊,倒出血水。用勻漿緩沖液漂洗組織碎塊,并將它們置于冰上,重復上述操作,直至組織碎成 1mm3 大小的碎片,且無可見的血。
2. 加入 5 倍(體積比)與組織塊體積的緩沖液,再置于冰浴的 Dounce 氏玻璃勻漿器中,抽研 10-20 次,勻漿組織。
3. 勻漿 4 攝氏度 600g 離心 10min ,上清含細胞膜、線粒體和細胞溶膠。沉淀中有未破碎的細胞及細胞核。棄沉淀。
4. 上清 4 攝氏度 8000g 離心 10min ,沉淀線粒體。棄沉淀。
5. 上清 4 攝氏度 10000g 離心 20min ,棄上清。
6. 用勻漿緩沖液重懸沉淀,繼續勻漿,再次 4 攝氏度, 10000g 離心 20min ,棄上清。
7. 用小體積的適宜緩沖液重新*勻漿沉淀。
8. 粗制的樣品可于干冰 / 乙醇中速凍,保存于 -80 攝氏度。
9 )用特殊的去污劑選擇性的分離。
簡單,可靠,但有時含有其他蛋白。
原理: 4 度時所有的蛋白質原則上都溶于 TritonX114 水溶液,但在 37 度時,此溶液分為水相和去污相;此時親水性蛋白溶于水相,疏水的膜蛋白溶于去污劑相中。
方案
1 、放射性標記受試細胞
2 、將標記的細胞放在冰上
3 、去除上清,用 pH7 。 4 的冷磷酸鹽緩沖液洗滌單層細胞兩次
4 、加入 1ml2%TritonX 溶液冰浴 15min
5 、刮下單層細胞, 4 度下 10 000g 5min 離心
6 、溶液 37 度水浴 10min 以分離水相和去污劑相,然后 37 度下 2 000g 離心 5min
7 、收集水相留作分析
8 、用 500ul 冰冷的 buffer C 溶解去污劑相沉淀,冰浴 2min 后加溫,在按步驟 6 再次離心
9 、按步驟 8 再次抽提去污劑相,用 buffer C 將洗滌后的去污劑相稀釋到初始體積
10 、用等量的 buffer A 分別稀釋水相與去污相,并進行免疫沉淀實驗
試劑:
1 ) 2%tritonX114:2%TritonX114 、 50mmol/L Tris HCl ( pH7 。 5 )、蛋白酶抑制劑
2 )緩沖液 A (含 0 。 5mol/LNaCl 的 RIPA buffer )
3 ) buffer C
10mmol/L Tris HCl(pH7.5)
150mmol/L NaCl
5mmol/L EDTA(PH7.5)
10 )植物中:高度純化的質膜是質膜蛋白研究的基礎,制備純化方法也很多,植物材料中以
1、蔗糖密度梯度離心、
2、水溶性雙水相法、
3、自由流電泳等方法為主。
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