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DNA專題:血基因組DNA提取實驗

2013-7-22  閱讀(1663)

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血基因組DNA提取可以:(1)從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細胞、培養細胞、病毒和線粒體中提取DNA;(2)用于后續測序、遺傳信息學等研究。

實驗方法
  • 血基因組DNA 試劑盒提取法
  • 血基因組DNA大量試劑盒提取法
  • 血基因組DNA中量試劑盒提取法
實驗方法原理 本試劑盒采用*的兩相分離技術,結合DNA制備膜選擇性地吸附DNA的方法達到純化基因組DNA的目的。適合從3ml的抗凝人或哺乳動物全血獲得100 μg的基因組DNA,抗凝鳥類或兩棲動物全血中獲得多至120 μg的基因組DNA。
實驗材料
試劑、試劑盒
儀器、耗材
實驗步驟
一、試劑盒組成、貯存、穩定性
 
說明書,耗材:中量制備管、中量濾器、連接管、塑料扳手、中量管蓋。
 
Buffer VL:細胞和病毒裂解液,室溫密閉貯存。
 
Buffer G-B:蛋白沉淀液,室溫密閉貯存。
 
Buffer DV-A:Buffer DV 的制備液,請參照實驗準備Buffer DV 的配制方法配制,室溫密閉貯存。
 
Buffer DV:相分離液,室溫密閉貯存。
 
Buffer BV:DNA 結合液,室溫密閉貯存。
 
Buffer W1:洗滌液,室溫密閉貯存。
 
Buffer W2 concentrate:去鹽液。使用前,根據瓶上數量加入乙醇,混合均勻,室溫密閉貯存。可用100%乙醇或95%乙醇。
 
Eluent:2.5 mM Tris-HCl,pH 8.5,室溫密閉貯存。
 
二、實驗準備
 
1. *次使用時,在Buffer W2 concentrate 中按試劑瓶上的體積加入無水乙醇。
 
2. 準備無核酸和核酸酶污染的Tip 頭、離心管。
 
3. 制備Buffer DV:取2 ml Buffer DV-A 125 ml 異丙醇,75 ml 異丁醇,加入提供的250 ml 試劑瓶中,混合均勻。
 
4. 4℃預冷Buffer DV。
 
三、操作步驟
 
【DNA 釋放 】
 
1. 將3 ml 抗凝全血加入一50 ml 離心管中,若全血樣本體積不足3 ml,用PBS 補充至3 ml。

2. 加入6 ml Buffer VL,蓋緊離心管帽,旋渦振蕩1 min。
 
3. 加入6 ml Buffer G-B,再次蓋緊離心管帽,立刻上下混勻。
 
【兩相分離去除蛋白和其它雜質】
 
4. 加入12 ml Buffer DV(4℃預冷),用力混合均勻。≥5 000×g 離心5 min。
 
* 請在實驗前按實驗準備中提供的方法準備Buffer DV。
 
5. 盡可能吸盡藍色上相,保留相間沉淀和下相。加入12 ml,4℃預冷Buffer DV,用力混合,≥5 000×g 離心5 min。
 
【基因組DNA 的純化】
 
6. 丟棄上相,將下相轉移至中量濾器中(濾器置于另一50 ml 離心管中),將活塞插入注射器,緩慢推動活塞,收集50 ml 離心管中的濾液。
 
* 上相必須*棄盡。
* 如在轉移過程中下相沒有任何界面沉淀,步驟6 可以省略。
 
7. 棄濾器,在濾液中加入6 ml Buffer BV,混合均勻。
 
8. 將連結管插到負壓裝置的插口上,再將DNA 中量制備管插到連結管上。將步驟7 的混合液移到制備管中,開啟并調節負壓裝置至-20-30 英寸汞柱,吸盡管中液體。
 
9. 保持負壓,加入8 ml Buffer W1,吸盡管中液體。
 
10. 保持負壓,加入9 ml 已加入乙醇的Buffer W2,吸盡管中液體。
 
* 確認在Buffer W2 concentrate 中已按試劑瓶上的體積加入無水乙醇。
 
11. 用塑料扳手將中量制備管中的DNA 結合部分從負壓裝置轉移至另一潔凈的1.5 ml 離心管中,加入0.3 ml Buffer W2,蓋上中量制備管蓋后,12 000×g 離心2 min。
 
12. 將DNA 結合部分置于另一潔凈的1.5 ml 離心管中,在silica 膜中央加0.5 ml Eluent 或去離子水,蓋上中量制備管蓋后,室溫靜置2 min,12 000×g 離心1 min 洗脫DNA。
 
* 將去離子水或Eluent 加熱至65℃將提高洗脫效率。
 
13. 可選步驟:同樣方法,在silica 膜中央加0.25 ml Eluent 或去離子水,蓋上中量制備管蓋后,室溫靜置1 min,12 000×g 離心1 min 洗脫DNA。
 
 
收起 
注意事項
1. Buffer VL,Buffer BV 和Buffer W1 含刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套和眼鏡,避免沾染皮膚、眼睛和衣服,謹防吸入口鼻。若沾染皮膚、眼睛時,要立即用大量清水和生理鹽水沖洗,必要時尋求醫療咨詢。

2. 在按照此說明書操作前,請確保已做好足夠的對血傳播病毒的防護工作,按照正確方法處理體液和感染源。
 
3. 操作時嚴格按操作步驟進行,廢物必須放入含消毒液的廢物缸,并高壓滅菌

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